La Dirección General de Fiscalización tiene como objetivo verificar el cumplimiento de las obligaciones fiscales en materia de impuestos locales de conformidad a lo establecido en el Código Financiero del Estado de México y Municipios, así como de los impuestos internos (ISR, IVA) y al comercio exterior en el marco del Convenio de Colaboración Administrativa en Materia Fiscal Federal celebrado entre el Gobierno del estado de México y la Secretara de Hacienda y Crédito Público.
Para hacer más eficaz y eficiente la función fiscalizadora, se implementó en julio de 2019 un “Nuevo Modelo de Fiscalización” el cual el cual consiste en Alinear a un solo proceso las actividades de las Direcciones de Área y Delegaciones de Fiscalización de la Dirección General de Fiscalización con el fin de simplificar y mejorar sus tareas y resultados. Este modelo concibe la recaudación de contribuciones como resultado de una ejecución adecuada del proceso fiscalizador.